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宣武医院
(第一临床医学院) -
附属北京友谊医院
(第二临床医学院) -
附属北京朝阳医院
(第三临床医学院) -
附属北京同仁医院
(第四临床医学院) -
附属北京天坛医院
(第五临床医学院) -
附属北京安贞医院
(第六临床医学院) -
附属北京积水潭医院
（第七临床医学院） -
附属复兴医院
(第八临床医学院) -
附属北京佑安医院
(第九临床医学院) -
附属北京胸科医院
(第十临床医学院) -
三博脑科医院
(第十一临床医学院) -
附属北京地坛医院
(第十二临床医学院) -
附属北京儿童医院
(儿科医学院) -
附属首都儿童医学中心（第二儿科医学院）
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附属北京口腔医院
(口腔医学院) -
附属北京安定医院
(精神卫生学院) -
附属北京妇产医院
(妇产医学院) -
附属北京中医医院
(中医药临床医学院) -
附属北京世纪坛医院
(肿瘤医学院) -
附属北京康复医院
(北京康复医学院) -
附属北京潞河医院
(潞河临床医学院) -
中国康复研究中心
(康复医学院) -
中日友好临床医学院
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北京市疾病预防控制中心
(预防医学教学基地)